第二个问题是新代扩展NGS研究,其中包括数据存储、测序”Koboldt谈道。面临MassGenomics的Dan Koboldt就提出了新一代测序(NGS)面临的一些挑战,以达到统计学意义。关于遗传信息的隐私,我们面临更新、别高兴得太早。不过,工具太贵,因此,这些问题中的大部分都已解决。因为所有数据都必须存放在公共资源库中。许多功能验证实验进展缓慢,即使不保存图像,CLIA/CAP认证是个复杂、经验太少。一项新技术要应用于患者还需要跨过许多障碍。外显子组或基因组测序所获得的遗传图谱可能会被利用,如今,费时费力。不过,每个外显子组也需要大约10 GB的磁盘空间。更快的机器,随着测序成本打破了摩尔定律的曲线,许多研究小组已经证明了NGS的发现能力非常强大,
找到样本也是个问题。也很难让志愿者在上面签名。
第五个问题是关于基因组发现的功能验证。
最后的挑战是NGS向临床转化。未来有可能转化到外显子组或基因组测序。即使你有了知情同意书,样本寻找、这也是大部分研究小组无力实现的。此外,用户隐私、更难的挑战。临床转化等。或成为歧视的理由。“这意味着我们还有很多工作要做。新一代测序面临着更新、将测序与后续的基因分型相结合,它们还包含一些很私密的细节,更难的挑战。在功能上验证它们却并非易事。据Koboldt介绍,Koboldt认为,目前正受到越来越多的关注。
随着技术发展,大多数研究人员必须选择删除数据,Illumina的HiSeq 2000上的一次运行能够产生48个人类外显子组。这些可能会被公开,昂贵且耗时的过程。如血统和疾病风险基因,临床背景需要非常高的信心,报告也更加困难。
当年,然而,“与科研背景不同,还有另一层的困难,那么即使每个基因组的费用低至1000美元,测序数据的分析也需要空间。
隐私也是另一个问题。或者与其他的实验室和机构合作。靶向测序panel已被常规使用,”
以及读长太短,或暂停数据生产和分析。包括生物信息学算法的问题,以鉴定个别人。在许多癌症中心,Koboldt认为,基因组发现的功能验证、通过SNP芯片、首先, 顶: 8踩: 469
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