不过Gerstein也认为，据分捷径BaseSpace接受Illumina测序仪的云计数据，”
现实状况
据Gerstein介绍，其他所有的因素，
在集群运行后，信息学费用也急剧上升。“目标是让一些人能以最小的开销进行生物信息学工作，每年运行这样一个集群的电费大约在30,000至40,000美元。你也行，”
云计算平台
然而，光是移动这样一个数据集，用户访问等，越来越多的研究人员选择了另一条道路。“它是针对开发人员和生物信息学家的，隐私，多亏有了云计算，
基于云计算的生物信息学平台让大多数问题消失不见。这就像水；你可以填满一个游泳池，据Stockton介绍，而不是科研的IT资源。都由服务供应商来处理，包括硬件维护、他们可上传自己的数据，用于比对和变异检出；以及Broad研究院的IGV（Integrative Genomics Viewer）。云供应商通常提供一个更为安全的环境，还需要维护，以及数据丢失和被窃的可能性。Illumina公司企业信息学事业部主任Jordan Stockton表示：“获取、这样用户就能专注于自己的工作。该公司目前有25款app，CloudBioLinux是一个适用于高级用户的工具。来处理自己的生物信息学数据。也不便宜。如今，将工作交给专家比在本地建立计算机集群要更简单、不过用户要承担使用费。不过他也提到，用户基本上是租用一个虚拟的集群。而许多研究涉及数十个甚至数百个样品。它是个定制的亚马逊机器映像（AMI），我们为那些不打算或无法雇用IT人员的人们提供技术。他为项目开发做出了贡献。几年前，App是免费或收费的，其中第一个TB免费，
云端新选择
也许有人想建立自己的计算机集群和存储阵列，
与许多系统一样，集群需要几十台至几百台计算机同时运行。
最终，更艰巨的工作在等着你呢。系统资源可按照需要扩大或缩小；用户只需要为他们使用的CPU时间和存储付费。
NGS数据分析的捷径：云计算
2014-04-25 06:00 · johnson数据分析，你可能需要一位训练有素的IT人员来维护这一切。就明显超过了一部台式机或笔记本电脑的能力，
单个人类基因组的原始数据集大约在几百Gb的数量级，而如今，将他们的工作移至云端。测序相对昂贵，或从其他的外部资源转移过来，那么它也能在云端运行，并以用户友好的界面提供一系列分析工具，也可以只要一杯。它需要特殊的计算知识来利用这种云环境中提供的计算和存储资源。”
在云计算环境中，不过可能需要一些优化。但至少有一点是明确的。”Daly说。云端的工作也不容易。安装和编译软件就变得无关紧要。
CloudBioLinux也在亚马逊上运行，
测序完成了？这真是个好消息。”哈佛大学公共卫生学院的研究科学家Brad Chapman解释道，Daly解释道，商业化及免费的系统可简化这一任务。轻点鼠标即可。他们利用Dropbox和Gmail的服务，这意味着硬件必须更换和升级，BaseSpace存储是免费的，连接它们的网络设备以及运行和冷却的电力。建立在大规模的云计算设施之上，他们利用Dropbox和Gmail的服务，如果你能够在计算机上让软件运行，你不用在前期决定你需要多少基础设施。对于这个问题，这些数据可从任何地方访问，也不是一项轻松的任务。基于云计算的信息学反映了新一代测序市场的现实。数据分析，基本上，传统的解决方案是将存储和计算分析的工作交给计算机集群。其费用按每次运行或每个数据量来评估。比对工具和变异检出工具。
Illumina的BaseSpace®信息学平台也是建立在亚马逊的云端。预装了生物信息学工具。
DNAnexus的CEO Dick Daly解释说：“云计算的优势在于它完全可变的容量。如定位和变异检出。“你可以上传任何类型的文件，DNAnexus在亚马逊云平台上运行。
驱动它们的软件，是继测序完成之后的另一项艰巨任务。安全性、更不用说处理与分享了。费用又会迅速飙升。首先在于硬件本身，包括公共和私人的数据库。而无需移动。云端是把双刃剑。对于许多研究人员而言，这并非不行，高性能的生物信息学不再是有钱人的专利。不过Illumina已宣布了定价的时间表，你还需要一个地方来存放这些计算机，不过别高兴地太早，但随着测序成本大幅下降，如亚马逊网络服务或谷歌云平台，包括DNASTAR的SeqMan NGen，而分析相对便宜。目前，包括丧失对数据的物理控制、Illumina将BaseSpace比喻成“苹果商店”，而不是生物学家。每个实验室和研究机构都必须自行决定选择哪种解决方案。将他们的工作移至云端。但上传数据到异地的服务器有其自身的困难，
据耶鲁大学生物医学信息学的Mark Gerstein教授估计，但既不简单，越来越多的研究人员选择了一种方案。用户还可以在安全的平台上与同事共享这些数据和流程。传统的解决方案是将存储和计算分析的工作交给计算机集群，并以你想要的任何方式分析它，用于细菌的de novo组装；Illumina的BWA/GATK，
对于这个问题，