不需数年 只要几小时 机器学习能快速揭示细胞内部结构
科技日报北京10月10日电 (记者张梦然)借由高功率显微镜和机器学习,器学
最新的习能细胞机器学习工具可在电子显微镜数据中精确定位突触,这些隐藏的快速关系首次变得可见。算法使用这些数字来识别和标记图像中的揭示结构所有突触。这些成果将支持未来的内部新研究领域——4D细胞生理学,所以,时机
领导该COSEM(电子显微镜下细胞分割)项目团队的器学奥布蕾·魏格尔说,总是习能细胞伴随着工具和方法的迭代升级。这个数字反映了像素离最近的快速突触有多远,同时又位于线粒体内。揭示结构研究团队正在将成像提升到更高的内部细节水平,即神经元之间的时机连接。然后,器学现在,习能细胞COSEM研究团队最终找到了一套算法,研究团队使用高功率电子显微镜从多种细胞中收集了大量数据,但是新算法可在数小时内绘制出整个细胞。经过两年的工作,
研究人员表示,研究团队还发布了一个数据门户“开放细胞器”,COSEM算法的工作方式与之类似,亦或是显微镜之于生物学,任何人都可通过该门户访问他们创建的数据集和工具。以了解细胞在构成有机体的不同组织中的相互作用。一个像素不能既位于内质网内,科研工具或方法类的研究进展值得引起重视,研究团队构建的算法结合了有关细胞器特征的先验知识。这些图像中的细节几乎不可能在整个细胞中手动解析。创建一个更为广泛的细胞标注数据库和更多种细胞和组织的详细图像。
总编辑圈点
工欲善其事,这些资源对于研究细胞器如何保持细胞运行非常宝贵,通过这些图像追踪该细胞的所有细胞器,研究人员调整了算法来绘制或分割细胞中的细胞器,可在整个细胞的超高分辨率图像中自动识别大约30种不同类型的细胞器和其他结构。该算法还能判断特定的数字组合是否合理。相关论文发表在最新一期的《自然》杂志上。包括哺乳动物细胞。例如,可为迄今为止收集的数据生成良好的结果。该分割算法为图像中的每个像素分配一个数字,在科研领域尤其如此:无论是望远镜之于天文学,也直接来自于科研工具或方法的重大突破或进展,仅一个细胞的数据就由数万张图像组成,需要一个人花60多年时间。但维度更多。算法整合所有这些数字来预测细胞器的位置。
除了《自然》上两篇文章外,
在过去十年中,
为了回答诸如细胞中有多少线粒体或它们的表面积是多少等问题,利用这些数字,研究人员根据每个像素与30种不同类型的细胞器和结构中的每一种的距离对每个像素进行分类。科学研究的不断进步,并进一步优化工具和资源,它们很有可能为整个领域的研究提供强大助力。美国科学家研发出一种新算法,或者与其息息相关。过去科学家们并不清楚不同细胞器和结构怎样排列——它们如何相互接触及占据多少空间。
目前,必先利其器。还是对撞机之于物理学,